好SCI論文的幾點經驗分享

一、研究結果整理

1. ? ? ?材料與方法

應該屬于論文中較容易寫的部分。但對于寫慣中文論文的作者（中文論文方法部分常常無需完整句子或三言兩語，無需參考文獻或對方法的論證），這部分也是審稿人最容易提出問題的部分。在實驗過程中積累的方法步驟可以放在這部分，但必須以完整句子的形式簡潔、準確描述，而不是記流水賬。

要明確提供材料包括試劑、細胞、動物的來源。方法的描述最好為下面結果的描述打下伏筆，以保持論文的一致性并方便讀者閱讀。

盡量采用大標題(Headings)和小標題(Subheadings)逐步描述。有些成熟的方法，簡述即可，并引用相關參考文獻。但如果是自創方法，則應詳細描述，尤其提出改進點和注意點，以表明其創新性。

2. ? ? ?結果

結果的描述順序最好與方法的一致。宜采用相應的大標題(Headings)逐步描述。所有有關的試驗或觀察指標應以適當的形式表達，但應該高度精練。信息量大的和/或非重要結果可以總結在表中，重要結果或信息量小的結果可用圖表示。

具概括性的結果表述或對有統計學意義或生物臨床重大意義的結果表述應體現在正文中。相應的圖表最好放在這些結果表述句末的括號中。

二、數據統計分析

由于統計分析涉及到的知識種類過于寬泛，現給大家介紹我以前解答過的問題，希望能對大家有所啟發。

問題1：文章投Proteomics Clinical Applications被拒，歷時2個月的review后，昨天收到郵件Rejected。這個雜志07年才從proteomics分出，現在還沒有IF，SCI-E收錄。

拒稿意見主要是實驗設計、統計問題，整理如下：

我做ABC三組的比較蛋白質學，兩兩間比較超過1.5倍的表達點D選出，酶解，MS。WB,RT驗證目的蛋白。

審稿人意見：

(1) ? ?兩兩間比較，t檢驗已有精確的p值，為何要選用1.5倍？既然要選擇D點，就不應該用兩兩間比較，而應該選用方差分析。

我的回復：如果不選用1.5倍，只用p值確定，那點更加多得不得了，酶解、ms都更費錢，所以當時就在基礎上再篩選，就選擇了表達1.5倍。至于用選擇D點沒用方差分析，如何解？

(2) ? ?WB,RT為何不用方差分析？

我的回復：WB,RT都是用定量的，比較用的也是兩組間的t檢驗。但在統計描述(methods and materials )的時候我直接copy了以前文章里面的描述，說計數資料用卡方檢驗；沒有提到計量資料，也沒有提到用方程分析。這該如何解釋？

麻煩夏教授給下意見，是否可以大修后再投？

夏教授：

1) Normally,the comparison for proteomics is between two groups.

I believe that you are trying to comparethree progressive pathologies such as normal, pre-cancerous and cancer in your study. If so, I am not sure if this is a good approach.

2) Although I am not familiar withproteomics, I did review some papers in proteomics. The so-called”differentially expression spots or proteins” are usually defined by”two-fold difference” or even “1.5-fold difference” (if you have a reason or reference to support you), but not defined by statistical analysis.

3) If you really want to use statistical analysis for three groups, you should use One-way ANOVA, not a simple T-testwhich is for two independent samples (groups).

問題2：生存期分析，一組病例數嚴重少于其他組病例數時該怎么統計？

我在統計一個關于三種不同基因型與患者生存期的問題，三個基因型分別是正常，雜合子和完全突變型，所用的受試人群完全是患者，在我的病例中發現，完全是正常的基因型的人數只在十例多，而突變型的總和達到了150多例，所以應該說患者的分型比較偏，而這個是患者的病例，而不是正常人的，所以出現偏的現象是很正常的。

雜合子和完全突變型的生存期的比較，我做K-M分析的時候，P值為0.07，但看曲線分的比我做出P值0.03的還開，明顯看出是基因正常的患者人數特別少。我懷疑可能會由于這個造成數據偏差。

聽說有一種統計方法可以做這種一組患者人數特別少的生存期，可是我不會，這該怎么辦，實在是已經非常接近0.05了，我希望有個統計學的平衡，讓我做的分析更科學，如果那樣也沒有意義我就認了。請夏教授指教！

夏教授：

很高興你得到一些陽性結果。

看過你寄來的數據，知道是有關基因多態性與某癌預后的關系。病例數應該是比較多的（當然還可以更多些）。得到Log Rank P值<0.07，不應該失望。你還有更多方法來全面分析：

1、基因型頻率(Genotype， TC, CC, T/C）和等位基因比率（Alleles,T：C)都可以用卡方分析。（作基因多態性的文章都用Hardy-Weinberg equilibrium，這個我不太懂）。

2、五年生存率比較。

3、Cox Regression是一定要做的。影響生存的因素（confounders）非常多，包括病理(TNM、Stage, Differentiation, site, size, etc)及手術、化療等等。或許，該基因多態性在Cox Regression分析中為獨立危險因素（即P<0.05

三、圖表選擇

科研論文的圖表一般是重要研究結果的展示，插圖質量的好壞往往也會直接影響著科研論文的發表。越來越多的研究者認識到了高質量的SCI論文插圖對于論文發表的重要性。

以下將介紹一般SCI雜志對插圖的各種要求，并說明如何在實際科研工作中做好原始數據和圖片的采集工作，希望能從根本上幫助科研工作者減少這類問題的發生。

1. SCI論文插圖一般要求：

1) 尺寸符合雜志社的要求（寬度8.3~17.6厘米，高度一般不超過20厘米）；

2) 字體符合雜志社的要求（Times NewRoman/Arial）；

3) 同類型文字的字號保持一致（Fontsize ≥ 8 pt，字體太小印刷版看不清楚）；

4) 線條粗細保持一致（Line weight;0.25~1 pt）；

5) 準確、清楚、有條理的圖片標記，插圖上所有元素對位整齊；

6) 插圖內容應占據整張插圖的90%以上空間，四周不能留太多空白區域；

7) 顏色模式符合雜志社的要求（RGB,CMYK）；

8) 圖片分辨率超過雜志社的最低要求（彩圖≥ 300 dpi；線條圖≥ 1000 dpi；灰度圖≥ 600 dpi；組合圖≥ 500 dpi）；

9) 格式符合規范（位圖，TIFF，矢量圖，PDF/EPS）；

10) 大小合適（每張插圖最好不超過10M，推薦保存為TIFF格式并選擇LZW無損壓縮模式）；

2.如何獲取高質量的原始素材？

大家在收集原始數據和圖片時，應特別注意獲取高質量的原始文件，并長期保存（1）照相機拍攝類照片

拍攝時應注意如下要點：

1) 注意攝入參照物。如需比較拍攝物尺寸大小的，應輔以鋼尺做參照，如腫瘤體積、裸鼠大小等；

2) 背景應盡量干凈，推薦以淺藍布作為背景，注意減少血漬及其他污染物的干擾；

3) 仔細檢查相機設置，分辨率越高越好，推薦2560×1920dpi及以上分辨率;

4) 對焦準確，不要逆光拍攝，多拍幾張；及時檢查效果并挑選可用的，正確命名，并將原始照片長期保存（不要用word或ppt保存）；

（2）條帶類圖片

拼圖前，條帶類圖片需要通過圖片軟件進行裁剪和預處理，并添加箭頭和分子量等文字說明。應注意：

1) 保持凝膠完整；

2) 拍照或掃描時應盡量設置較高的分辨率，原始分辨率不低于300 dpi，越高越好，保存為TIFF格式備用。

（3）顯微鏡、電鏡、共聚焦顯微鏡圖片

這類照片包括黑白圖和彩色圖。拼圖前，往往需要預處理添加標尺和調整大小等。

應注意如下要點：

1) 盡量獲取高分辨率的圖片，原始分辨率不低于600dpi，越高越好，保存為TIFF格式備用；

2) 注意添加標尺，至少在同批次、同參數的系列照片中的一張上添加，否則后期沒有參照將無法處理。

（4）數據圖表類結果

一般由數據處理軟件生成，如Excel, Origin, Graphpad, SPSS等，屬于線條圖范疇，要求分辨率不低于1000dpi，或直接通過PDF/EPS格式投稿（如雜志社允許）。

應注意如下要點：

1) 原始數據必須完整、準確；

2) 分析儀器記錄的數據最好導出為Excel格式，以便統計軟件識別和處理。

3) 將圖表轉化成PDF格式，必要時可通過AI對PDF格式圖表進行編輯；

4) 所有原始數據和圖表，皆應長期保存，必要時雜志社可能會要求提供數據分析的結果不要截圖，盡量不使用圖片形式保存結果，以免后續不好修改。

（5）編輯公司協助處理的插圖

雖然論文編輯公司有協助制作SCI論文插圖的服務，但很多作者只關心最終的結果——圖片本身，卻往往忽略了處理過程中的產生的源文件。

應注意如下要點：

1) 繪制類插圖，要求提供PDF版，必要時提供符合雜志社要求的高分辨率TIFF圖片；

2) 照片類插圖（如拼圖服務，壁報排版等），要求提供高分辨率TIFF圖片，并提供軟件處理過程中的源文件（如PS處理過程中產生的PSD源文件），以便后期修改。

最后必須要強調的是，在準備SCI論文插圖的每個環節，請務必遵守科研道德及出版倫理的基本原則：不篡改數據、不捏造結果、不偽造圖片！

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來源：美捷登科學網博客

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